Ферментативная CLICK-функционализация РНК

Реакционные "КЛИК"-группы - такие, как азиды или алкины, ферментативно встраиваются в РНК/кРНК через соответственным образом модифицированные нуклеотиды, которые включаются вместо их натуральных аналогов (Таблица 1). Чтобы обеспечить оптимальные свойства субстрата, ядро структуры наших модифицированных нуклеотидов является производным от натуральных аналогов с нужной реакционной группой, присоединенной оптимизированным линкером в одной из благоприятных позиций (цитидин/уридин: C-5 позиция).

Получившиеся КЛИК-функционализированные РНК/кРНК могут впоследствие быть обработаны в медь-катализируемой (азид-алкиновой) или не использующей медь (азид-DBCO) клик-реакции, что позволяет:

• встроить Биотиновую группу для последующей очистки (используя Азид-Биотиновые, Алкин-Биотиновые or DBCO-содержащие биотинилирующие реагенты)
• для встраивания флуоресцентной группы для последующей визуализации (используя флуоресцентные Азиды, флуоресцентные Алкины, DBCO-содержащие флуоресцентные красители)
• для связывания белков к комплементарным КЛИК-функционализированным биомолекулам, например, ДНК

yPAP: Дрожжевая поли(А) полимераза; TdT: Терминальная деоксинуклеотидил Трансфераза.

1:собственные данные

2: внешние ссылки(см.документацию)

n/a: нет данных

- : неприменимо

		cRNA мечение в in vitro Транскрипции используя ...			3’-RNA мечение используя ...
Нуклеотид	Cat. No.	SP6 RNA Polymerase	T7 RNA Полимераза	T3 RNA Полимераза	yPAP	TdT	T4 RNA Лигаза
UTP
5-Азидо-C3-UTP	NU-157	n/a	✔1,2	n/a	-	-	-
5-Ethynyl-UTP	CLK-T08	n/a	✔2	n/a	-	-	-
ATP
8-Азидо-ATP	NU-155	-	-	-	✔2	-	-
3ґ-dATP (производная кордицепина)
N6-Азидогексил-3ґ-dATP	NU-1707	-	-	-	n/a	-	-
Цитидин-5ґ/3ґ-фосфат
pCp-Азид	NU-1708	-	-	-	-	-	n/a

Кроме того, обратите внимание на Азид-модифицированные, Алкин-модифицированные or DBCO-модифицированные нуклеотиды.

РНК