1. Каталог >
  2. Реактивы >
  3. Методы >
  4. ПЦР >
  5. ПЦР в реальном времени >
  6. Основные наборы для количественной ПЦР >

qPCR Probes Core Kit

Набор для количественной ПЦР в реальном времени с использованием меченых ДНК-зондов

Хранить при -20°C
Избегать повторного замораживания/размораживания
Срок годности: 12 месяцев

Набор PP-331 предназначен для количественного real-time анализа образцов ДНК с детекцией на основе ДНК-зондов. Набор рекомендован для использования с флуоресцентными зондами с двойной меткой, например TaqMan®, молекулярными маяками или FRET-зондами. Он предоставляет мощный инструмент для количественной оценки образцов ДНК в широком динамическом диапазоне с исключительной чувствительностью и точностью.
Высокая специфичность и чувствительность набора достигается при помощи оптимизированной полимеразы горячего старта. Ее активность блокируется при умеренной температуре и автоматически включается при старте начальной денатурации. Температураня активация предотвращает элонгацию неспецифически отжигающихся праймеров и праймер-димеров при низких температурах в процессе подготовки ПЦР. Поставляемая в комплекте смесь нуклеотидов содержит dUTP вместо dTTP и позволяет проводить обработку UNG (Урацил-N-Гликозилазой) в начале термоциклирования для предотвращения контаминации переносимой из предыдущих реакций ДНК.
Реагенты набора оптимизированы для использования в блочных ПЦР-инструментах. Набор также может использоваться с ROX референсным красителем в ПЦР-инструментах, совместимых с оценкой ROX сигнала. В этом случае, краситель ROX должен добавляться к ПЦР реакции в 1х концентрации.

Название Код Цена Количество
L pack PCR-331L 49700.7 руб. 500 reactions x 50 µl
S pack PCR-331S 12847.92 руб. 100 reactions x 50 µl


Документы
Datasheet


В набор входит

PCR-331S
(100 реакций)
PCR-331L
(500 реакций)
qPCR Pol, 5 ед./µl
(красная крышка)
30 µl 130 µl
Смесь dNTP (вкл. dUTP)
10 mM dATP, 10 mM dCTP, 10 mM dGTP, 20 mM dUTP
(белая крышка)
120 µl 600 µl
qPCR-буфер готовый, 10х конц.
200 mM Tris-HCl (pH 8.5), KCl, (NH4)2SO4 , 30 mM MgCl2 и стабилизаторы
(зеленая крышка)
1 ml 3 * 1 ml
qPCR-буфер без MgCl2, 10х конц.
200 mM Tris-HCl (pH 8.5), KCl, (NH4)2SO4 и стабилизаторы
(синяя крышка)
1 ml 3 * 1 ml
MgCl2, стоковый раствор
25 mM MgCl2
(желтая крышка)
1.2 ml 5 * 1.2 ml

ДНК-зонды с двойной меткой

Технология ПЦР в реальном времени, основанная на ДНК-зондах с двойной меткой, обеспечивает высокую чувствительность и специфичность ПЦР-систем, в том числе мультиплексных (многолокусных). Для этого требуется два стандартных ПЦР-праймера и ДНК-зонд, который гибридизуется к внутренней части ампликона. Последовательность ДНК-зонда с двойной меткой подбирается таким образом, чтобы избегать формирования вторичной структуры и праймер-димерных образований.

Подготовка мастермикса для qPCR

Подготовка мастермикса - ключевой этап в количественной ПЦР для уменьшения ошибок дозирования. Подготовьте мастермикс всех компонентов кроме матрицы, как указано ниже. Рекомендованный для большинства инструментов объем реакции - 20-50 µl. Подготовьте 13 объемов мастермикса для 12 образцов или тройного комплекта из 4 образцов. Дозируйте наконечниками со стерильными фильтрами и минимизируйте пребывание меченых ДНК-зондов на свету. Желательно производить подготовку в зоне, отдельной от зон подготовки ДНК и анализа. Отрицательный котроль должен быть включен во все амплификации.

1 х 50 µl 13 х 50 µl Итоговая концентраци
qPCR-буфер готовый 5 µl 65 µl
Смесь dNTP 1 µl 13 µl 200 µM
Прямой праймер (10 µM)1 1.5 µl 19.5 µl 300 nM
Обратный праймер (10 µM)1 1.5 µl 19.5 µl 300 nM
Проба с двойной меткой (10 µM)2 1 µl 13 µl 200 nM
UNG (PCR-353)3 0.2 µl 2.6 µl 0.2 ед./пробу
qPCR Pol 3 0.25 µl 3.25 µl 0.025 ед./µl
Вода для ПЦР Долить до 40 µl Долить до 520 µl -
1) Оптимальная концентрация каждого праймера может варьировать от 100 до 500 nM.
2) Оптимальные результаты могут требовать титрования концентрации ДНК зондов между 50 и 800 nM.
3) Требуется только если требуется обработка UNG (Урацил-N-Гликозилазой) для предотвращения переносимой контаминации ДНК. UNG не поставляется в данном наборе.

Оптимизация концентрации MgCl2

Рекомендуемая для большинства приложений концентрация Mg2+ 3.0 mM имеется в 10х готовом qPCR буфере (зеленая крышка). Для индивидуальной оптимизации используйте реакционный буфер без MgCl2 и добавляйте стоковый раствор MgCl2 как указано в таблице ниже.

MgCl2 стоковый раствор 4 µl 6 µl 8 µl 12 µl
Итоговая концентрация MgCl2 2 mM 3 mM 4 mM 6 mM

Дозирование мастермикса:

Тщательно перемешайте мастермикс на вортексе для достижения гомогенности. Перенесите по 40 µl в ПЦР пробирки или лунки ПЦР-планшета.

Добавление ДНК-матрицы:

Добавьте 10 µl препарата ДНК-матрицы к каждой реакционной емкости, содержащей 40 µl мастермикса и закройте или запечатайте пробирку/планшет. Не добавляйте более 500 ng ДНК на 50 µl реакции в итоговой концентрации. Пробирки или планшеты должны быть центрифугированы перед термоциклированием для удаление возможных пузырьков.

Рекомендуемые условия термоциклирования



Обработка UNG4 50°C 2 минуты
Начальная денатурация и активация полимеразы 95°C 2 минуты
Денатурация 95°C 15 секунд 30-40х
Отжиг и элонгация 60-65°C5 30 секунд6 30-40х
4) Этап включается в программу только если требуется обработка UNG (Урацил-N-Гликозилазой).
5) Температура отжига зависит от температуры плавления используемых праймеров и ДНК-зондов.
6) Время элонгации зависит от длины апмпликона. Рекомендуется устанавливать время в 1 минуту для фрагмента до 500 п.н. Для оптимальной специфичности и амплификации может быть необходим индивидуальный подбор параметров, особенно температуры отжига и концентрации MgCl2, для каждой комбинации ДНК-матрицы, пар праймеров и ДНК-зондов.

Информация представлена исключительно в ознакомительных целях и ни при каких условиях не является публичной офертой