1. Каталог >
  2. Jena Bioscience >
  3. Макромолекулярная кристаллография >
  4. Скрининг >

Фрагментный скрининг



Одной из основных проблем в фармацевтических исследованиях является идентификация химических групп, которые специфически взаимодействуют с конкретным белком-мишенью. Как правило, это решается скринингом с высокой пропускной способностью (HTS), однако, в последнее время становится все более популярным "Фрагментный скрининг". При фрагментном скрининге набор малых молекул ("фрагментов"), обычно с молекулярной массой < 300 Da и низкой аффинностью, оцениваются на специфическое взаимодействие с мишенью. Кристаллография/рентгентовская дифракция показывает не только то, связывается ли фрагмент с белком, но также где и как происходит связывание и поэтому является более полезным методом скрининга. Фрагменты затем химически модифицируются в нескольких циклах оптимизации/тестирования до тех пор, пока не будет получена структура с высокой аффинностью. Поскольку такой "фрагментный" подход позволяет проводить проверку более широкого диапазона соединений по сравнению с большими библиотеками определенных соединений, прогнозируемая эффективность фрагментного скринига в 10-1000 раз выше, чем традиционного HTS[4].

Набор Frag Xtal Screen позволяет легко приступить к основанным на фрагментный скрининге исследованиям (fragment-based lead discovery - FBLD) кристаллографическим тестированием:

  • 96 фрагментов
  • Высокая растворимость фрагментов позволяет достигать высокой концентрации при замачивании(> 90 mM; может зависеть от условий замачивания)
  • Собственные тесты с высоким кристаллографическим уровнем попаданий
  • Проверенные рентгентовские попадания для различных целевых классов в белковых банках данных.
  • Разнообразная и репрезентативная библиотека фрагментов для большого химического диапазона.
  • Доступны следующие по порядку соединения
Формулы Frag Xtal Screen [PDF]

Frag Xtal Screen в новостях сайта
НазваниеКодЦена
Frag Xtal - набор для фрагментного скрининга X-FS-101 98664.11 руб. 96 фрагментов (2x 50 nmol каждого)



Источники и литература

[1] Huschmann et al. (2016) Structures of endothiapepsin-fragment complexes from crystallographic fragment screening using a novel, diverse and affordable 96-compound fragment library. Acta Cryst F 72:346.
[2] Schiebel et al. (2016) Six Biophysical Screening Methods Miss a Large Proportion of Crystallographic Discovered Fragment Hits: A Case Study. ACS Chem. Biol. 11:1693.
[3] Schiebel et al. (2015) One Question, Multiple Answers: Biochemical and Biophysical Screening Methods Retrieve Deviating Fragment Hit Lists. ChemMedChem 10:1511.
[4] Hajduk and Greer (2007) A decade of fragment-based drug design: strategic advances and lessons learned. Nature Reviews Drug Discovery 6:211.
[5] Rees et al. (2004) Fragment-based lead discovery. Nature Reviews Drug Discovery 3:660.


Информация представлена исключительно в ознакомительных целях и ни при каких условиях не является публичной офертой